L'historique de la Protection nationale et celui du Haut-Commissariat de la Protection nationale (HCPN) sont étroitement liés.
Suite aux attentats terroristes du 11 septembre 2001, un nouveau concept organisationnel et fonctionnel de Protection nationale a été développé et mis en place avec pour objectif de pourvoir le pays d'un concept global de prévention et de gestion civile et militaire des crises. Cette nouvelle approche dite "tous secteurs - tous risques " consiste à prendre en compte tous les secteurs, quel que soit la nature des risques qu'ils présentent ou auxquels ils sont exposés et s'étend de l'analyse des risques à l'élaboration de mesures de protection pour identifier et contrecarrer l'intégralité des risques potentiels.